תטען אותו אחרון, שם אתה יכול להכניס את השינויים שאתה רוצה, תיצור לך קלאסים\תקסטם את הבוטסטראפ לפי הקלאסים שלו(תשתמש פשוט בINSPECT ELEMNT\פיירבאג).

סתם דוגמה:
.navbar-inverse .navbar-nav > .active > a, .navbar-inverse .navbar-nav > .active > a:hover, .navbar-inverse .navbar-nav > .active > a:focus {
color: #000;
background-color: #fff;
}