תולדות הסכסוךהקרע בין נתניהו לבנט החל כשבנט עבד בלשכתו. ראש האופוזיציה דאז הבחין כי ניירות ומסמכים נעלמים מהלשכה, וכי חלקם אף מוצאים את דרכם לתקשורת. בשלב הזה ניסה בנט לעשות הפרד ומשול: נתניהו טוב, שרה רעה. זה גם מה שהשתקף בתקשורת בהדלפות מאירועים שונים. באחת ההדלפות למשל, נאמר כי בנט הטיח בפני שרה נתניהו כי הוא לא עובד עבורה, אלא עבור בעלה, ראש האופוזיציה. משפט זה, נטען, הוא שגרם לקרע שהוביל בסופו של דבר לפרישתו של בנט מהלשכה - אלא שמשפט זה מעולם לא נאמר.
לאחר פרישתו של בנט התפרסמה ידיעה גדולה על מקרה שבו נתניהו ורעייתו דרשו מבנט ומאיילת שקד, שהיתה אז מנהלת הלשכה, להחזיר את הצ'קים שרשם נתניהו לשניהם. המדובר בצ'קים שבנט דרש כתנאי להמשך העסקתו בלשכה, זאת נוסף על המשכורות שקיבלו מהכנסת כראש לשכת יו"ר האופוזיציה וכמנהלת הלשכה. בין שהפרטים נכונים ובין שלא, בפגישה נכחו רק ארבעה אנשים: בנימין ושרה נתניהו, נפתלי בנט ואיילת שקד. אבל הפגישה בכל זאת דלפה לתקשורת, וברור לכל מי הם השניים שבטוח לא הדליפו את תוכנה.
האי אמון שחש נתניהו כלפי בנט הלך וגבר, וכמוהו זרם ההדלפות והחומרים שהמשיכו להיעלם (אגב רובם חסרים עד היום, כולל תיקיות שלמות של ניירת הקשורה לניהול הפריימריז באותה תקופה, רישומי יומן ואפילו פתקים שהעביר נתניהו לעובדי לשכתו בנושאים שונים.( נתניהו חש כי בנט הגיע לעבוד בלשכתו אחרי האקזיט המרשים שביצע בתחום ההיי-טק כדי לקדם אדם אחד בלבד: נפתלי בנט. בסופו של דבר הראה לו נתניהו את הדלת החוצה.
מאז פוטר מהלשכה לא חדל בנט לתקוף את נתניהו, ובעיקר את שרה. בקמפיין הבחירות זה הגיע לשיא, בייחוד אחרי האמירה על קורס הטרור שעברו יחד. בנט יודע כי הציבור שהוא מייצג, רואה בנתניהו מועמד לראשות ממשלה ולכן הוא נזהר בכבודו. שרה מהבחינה הזאת היא כר נוח יותר למתקפות מצידו.
בסך הכל שימש בנט בחייו בשני תפקידים ציבוריים. הראשון בלשכת נתניהו, והשני במועצת יש"ע. בשני המקומות, אחרי לא הרבה זמן, התאכזבו ממנו וביקשו לסיים את תפקידו. בשני המקרים היו מי שטענו כי הרקע היה בעיות אמינות קשות.
את יחסו של בנט לנתניהו אפשר ללמוד גם לפי חוג היועצים שבו הוא נעזר לפני הבחירות ואחריהן, ובו שלום שלמה, יועז הנדל ולאחרונה גם ליאור חורב. היועץ המשפטי של הבית היהודי הוא עו"ד איתן הברמן, לשעבר יועצה המשפטי של קדימה בראשות ציפי לבני. המשותף לכולם הוא שהם לפחות בעבר פעלו נגד נתניהו.